ディオの呪縛をうけた伝説の騎士・タルカスとのチェーン首輪デスマッチに苦戦するジョジョ。 そんなジョジョを救うことが自らの運命と感じたツェペリが…!? 多くの人々の意志、勇気そして未来への希望を胸に、ジョジョはディオとの最後の戦いに挑む！

黒騎士ブラフォードを退けたのも束の間、殺人修練場でタルカスとのチェーン首輪デスマッチが始まった！ 予言の時が迫り来る中、ツェペリはジョジョに最後の波紋を託す！

ディオとの青春に決着をつける！ 炎に包まれゆく邸で自らの命をかけディオと立ち向かうジョジョ。 壮絶なる戦いの末、ディオは滅びたかにみえた…。 だがその悪なる魂と肉体は生きていた！ 石仮面が作り出した不死身の魔物をうち砕くすべはあるのか…!?

ディオはジョジョを倒し、世界を支配するという野望を持って復活を果たす。 ジョジョはツェペリと出会い波紋を習得、打倒ディオを誓う。 ディオの下へ向かうジョジョたちに暗黒の騎士達が迫る！

イギリス貴族ジョースター家の一人息子・ジョナサン。 紳士となることを目指し不自由ない暮らしを送っていた。 だがその生活は「侵略者」ディオ・ブランドーの出現で一変。 事あるごとにジョジョを陥れるディオの傍らには、石仮面が不気味にたたずみ……。

財産の乗っ取り計画がバレたディオは、自ら仮面をかぶってジョジョに対決を挑む。 激闘の末、ディオは業火で焼け落ちたジョースター家とともに消えたが…。

19世紀末英国。 貴族・ジョースター卿は恩人の息子、ディオを養子にする。 しかしディオはジョースター卿の実の息子、ジョナサン（ジョジョ）を退け、財産の横取りを計画！ 謎の石仮面でジョジョを殺そうと画策する。